中病毒后导致一部分软件无法正常使用

一台台式机，以前用这个系统运行任何软件都是正常的，自从中了病毒以后，导致部分软件无法使用；经多次对硬盘分区以及格式化后，重新安装系统后，安装原来可以运行的软件，结果还是无法运行。有的时候装好系统后，安装该软件可以运行，有的时候就不行。一点击软件就关机或者一直无反应。请求帮助该如何处理？